Вірус синього вуха схильний до мутацій.Незалежно від того, чи сталося ціле стадо ссавців на фермі імунітетом до останнього спалаху хвороби синього вуха, або ціле стадо було замінено і всі свині негативні для хвороби синього вуха, ці ферми все ще вразливі до спалахів хвороби синього вуха від різних штамів вірусу.